Mrkšić se od 2012. nalazio u zatvoru u Lisabonu po presudi Međunarodnog suda za ratne zločine u bivšoj Jugoslaviji koji ga je osudio na 20 godina zatvora zbog pomaganja i podržavanja mučenja, okrutnog postupanja i ubojstva 194 hrvatska zarobljenika na farmi Ovčari u studenom 1991. godine.
U posljednje vrijeme zdravstveno stanje mu se pogoršalo, a Srbija je baš sutra planirala zatražiti da ga se hitno pusti na privremenu slobodu radi liječenja.
Mrkšić je na optužnici ICTY-a zbog zločina na Ovčari bio zajedno s pripadnicima bivše JNA Veselinom Šljivančaninom i Miroslavom Radićem, a vijeće Haškog tribunala osudilo ga je na 20 godina zatvora, Šljivančanina na pet godina, dok je trećeoptuženi Radić oslobođen krivnje, piše HRT.